Metiltrasferasi di tipo 3
DNA (cytosina-5)-metiltransferasi di tipo 3 è un enzima che negli umani è codificato dal gene DNMT3L.[1][2]
| Metiltrasferasi di tipo 3 | |
|---|---|
| Gene | |
| HUGO | DNMT3L |
| Entrez | 29947 |
| Locus | Chr. 21 q22.3 |
| Proteina | |
| OMIM | 606588 |
| UniProt | Q9UJW3 |
La metilazione CpG è una modificazione epigenetica che è importante per lo sviluppo embrionale, l'imprinting, e l'inattivazione del cromosoma X. Studi su topi hanno dimostrato che la metilazione del DNA è richiesta per lo sviluppo dei mammiferi. Questo gene codifica una proteina nucleare somigliante con la DNA metiltransferasi. Questa proteina non ha una funzione come la DNA metiltransferasi perché non contiene i residui aminoacidici necessari per l'attività metiltransferasi. Tuttavia, questa proteina stimola la metilazione de novo da parte della DNA citosina metiltransferasi 3 alpha e questo è stato pensato essere necessario per lo stabilirsi delle impronte genomiche materne. Questa proteina media anche la repressione trascrizionale attraverso l'interazione con l'istone deacetilasi 1. Lo splicing alternativo risulta in due varianti di trascrizione. Una giunzione variante addizionale è stata descritta, ma la sua validità biologica non è stata determinata.[2] Ulteriori studi hanno dimostrato che Dnmt3L è un essenziale regolatore di imprinting paterno e dell'inizio della meiosi maschile. La perdita di un allele Dnmt3L porta ad un contenuto ridotto della proteina DNMT3L nello sperma.[3]
DNMT3L ha dimostrato di avere interazione proteina-proteina con HDAC1.[4][5]
Note
modifica- ^ Aapola U, Kawasaki K, Scott HS, Ollila J, Vihinen M, Heino M, Shintani A, Kawasaki K, Minoshima S, Krohn K, Antonarakis SE, Shimizu N, Kudoh J, Peterson P, Isolation and initial characterization of a novel zinc finger gene, DNMT3L, on 21q22.3, related to the cytosine-5-methyltransferase 3 gene family, in Genomics, vol. 65, n. 3, agosto 2000, pp. 293–8, DOI:10.1006/geno.2000.6168, PMID 10857753.
- ^ a b Entrez Gene: DNMT3L DNA (cytosine-5-)-methyltransferase 3-like, su ncbi.nlm.nih.gov.
- ^ DNMT3L is a regulator of X chromosome compaction and post-meiotic gene transcription, in Plos one., vol. 6, n. 3, Australia, marzo 2011, pp. 1-12, PMID e18276.
- ^ Ulla Aapola, Liiv Ingrid, Peterson Pärt, Imprinting regulator DNMT3L is a transcriptional repressor associated with histone deacetylase activity, in Nucleic Acids Res., vol. 30, n. 16, England, agosto 2002, pp. 3602–8, DOI:10.1093/nar/gkf474, PMC 134241, PMID 12177302.
- ^ Rachel Deplus, Brenner Carmen, Burgers Wendy A, Putmans Pascale, Kouzarides Tony, de Launoit Yvan, Fuks François, Dnmt3L is a transcriptional repressor that recruits histone deacetylase, in Nucleic Acids Res., vol. 30, n. 17, England, settembre 2002, pp. 3831–8, DOI:10.1093/nar/gkf509, PMC 137431, PMID 12202768.
Bibliografia
modifica- Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, T. D. Taylor, H. Watanabe, T. Yada, H.-S. Park, A. Toyoda e K. Ishii, The DNA sequence of human chromosome 21, in Nature, vol. 405, n. 6784, 2000, pp. 311–9, DOI:10.1038/35012518, PMID 10830953.
- Hata K, Okano M, Lei H, Li E, Dnmt3L cooperates with the Dnmt3 family of de novo DNA methyltransferases to establish maternal imprints in mice, in Development, vol. 129, n. 8, 2002, pp. 1983–93, PMID 11934864.
- Burgers WA, Fuks F, Kouzarides T, DNA methyltransferases get connected to chromatin, in Trends Genet., vol. 18, n. 6, 2002, pp. 275–7, DOI:10.1016/S0168-9525(02)02667-7, PMID 12044346.
- Aapola U, Liiv I, Peterson P, Imprinting regulator DNMT3L is a transcriptional repressor associated with histone deacetylase activity, in Nucleic Acids Res., vol. 30, n. 16, 2002, pp. 3602–8, DOI:10.1093/nar/gkf474, PMC 134241, PMID 12177302.
- Deplus R, Brenner C, Burgers WA, P Putmans, T Kouzarides, Y De Launoit e F Fuks, Dnmt3L is a transcriptional repressor that recruits histone deacetylase, in Nucleic Acids Res., vol. 30, n. 17, 2002, pp. 3831–8, DOI:10.1093/nar/gkf509, PMC 137431, PMID 12202768.
- Kierszenbaum AL, Genomic imprinting and epigenetic reprogramming: unearthing the garden of forking paths, in Mol. Reprod. Dev., vol. 63, n. 3, 2003, pp. 269–72, DOI:10.1002/mrd.90011, PMID 12237941.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, JG Derge, RD Klausner, FS Collins, L Wagner, CM Shenmen e GD Schuler, Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences, in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 99, n. 26, 2003, pp. 16899–903, DOI:10.1073/pnas.242603899, PMC 139241, PMID 12477932.
- Chedin F, Lieber MR, Hsieh CL, The DNA methyltransferase-like protein DNMT3L stimulates de novo methylation by Dnmt3a, in Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., vol. 99, n. 26, 2003, pp. 16916–21, DOI:10.1073/pnas.262443999, PMC 139244, PMID 12481029.
- Huntriss J, Hinkins M, Oliver B, S.E. Harris, J.C. Beazley, A.J. Rutherford, R.G. Gosden, S.E. Lanzendorf e H.M. Picton, Expression of mRNAs for DNA methyltransferases and methyl-CpG-binding proteins in the human female germ line, preimplantation embryos, and embryonic stem cells, in Mol. Reprod. Dev., vol. 67, n. 3, 2004, pp. 323–36, DOI:10.1002/mrd.20030, PMID 14735494.
- Suetake I, Shinozaki F, Miyagawa J, H Takeshima e S Tajima, DNMT3L stimulates the DNA methylation activity of Dnmt3a and Dnmt3b through a direct interaction, in J. Biol. Chem., vol. 279, n. 26, 2004, pp. 27816–23, DOI:10.1074/jbc.M400181200, PMID 15105426.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, CM Shenmen, LH Grouse, G Schuler, SL Klein, S Old e R Rasooly, The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC), in Genome Res., vol. 14, 10B, 2004, pp. 2121–7, DOI:10.1101/gr.2596504, PMC 528928, PMID 15489334.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Tomoko Hirozane-Kishikawa, Amélie Dricot, Ning Li, Gabriel F. Berriz, Francis D. Gibbons e Matija Dreze, Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network, in Nature, vol. 437, n. 7062, 2005, pp. 1173–8, DOI:10.1038/nature04209, PMID 16189514.
- Hata K, Kusumi M, Yokomine T, En Li e Hiroyuki Sasaki, Meiotic and epigenetic aberrations in Dnmt3L-deficient male germ cells, in Mol. Reprod. Dev., vol. 73, n. 1, 2006, pp. 116–22, DOI:10.1002/mrd.20387, PMID 16211598.
- Xie ZH, Huang YN, Chen ZX, AD Riggs, JP Ding, H Gowher, A Jeltsch, H Sasaki e K Hata, Mutations in DNA methyltransferase DNMT3B in ICF syndrome affect its regulation by DNMT3L, in Hum. Mol. Genet., vol. 15, n. 9, 2006, pp. 1375–85, DOI:10.1093/hmg/ddl059, PMID 16543361.
- Yokomine T, Hata K, Tsudzuki M, Sasaki H, Evolution of the vertebrate DNMT3 gene family: a possible link between existence of DNMT3L and genomic imprinting, in Cytogenet. Genome Res., vol. 113, 1–4, 2006, pp. 75–80, DOI:10.1159/000090817, PMID 16575165.
- Hu YH, Warnatz HJ, Vanhecke D, Florian Wagner, Andrea Fiebitz, Sabine Thamm, Pascal Kahlem, Hans Lehrach e Marie-Laure Yaspo, Cell array-based intracellular localization screening reveals novel functional features of human chromosome 21 proteins, in BMC Genomics, vol. 7, 2006, p. 155, DOI:10.1186/1471-2164-7-155, PMC 1526728, PMID 16780588.
- Kareta MS, Botello ZM, Ennis JJ, C Chou e F Chédin, Reconstitution and mechanism of the stimulation of de novo methylation by human DNMT3L, in J. Biol. Chem., vol. 281, n. 36, 2006, pp. 25893–902, DOI:10.1074/jbc.M603140200, PMID 16829525.
- Ooi SK, Qiu C, Bernstein E, Keqin Li, Da Jia, Zhe Yang, Hediye Erdjument-Bromage, Paul Tempst e Shau-Ping Lin, DNMT3L connects unmethylated lysine 4 of histone H3 to de novo methylation of DNA, in Nature, vol. 448, n. 7154, 2007, pp. 714–7, DOI:10.1038/nature05987, PMC 2650820, PMID 17687327.
- Jia D, Jurkowska RZ, Zhang X, Albert Jeltsch e Xiaodong Cheng, Structure of Dnmt3a bound to Dnmt3L suggests a model for de novo DNA methylation, in Nature, vol. 449, n. 7159, 2007, pp. 248–51, DOI:10.1038/nature06146, PMC 2712830, PMID 17713477.
- DNMT3L is a regulator of X chromosome compaction and post-meiotic gene transcription, in Plos one., vol. 6, n. 3, Australia, marzo 2011, pp. 1-12, PMID e18276.