Le qualificazioni del doppio femminile del Pilot Pen Tennis 2006 sono state un torneo di tennis preliminare per accedere alla fase finale della manifestazione. I vincitori dell'ultimo turno sono entrati di diritto nel tabellone principale. In caso di ritiro di uno o più giocatori aventi diritto a questi sono subentrati i lucky loser, ossia i giocatori che hanno perso nell'ultimo turno ma che avevano una classifica più alta rispetto agli altri partecipanti che avevano comunque perso nel turno finale.
Le qualificazioni del doppio del torneo Pilot Pen Tennis 2006 prevedevano 4 coppie partecipanti di cui una è entrata nel tabellone principale.
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- w/o = Walkover
- r = Ritirato
- d = Squalificato
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Tennis
Anastasija Rodionova / 
Andreea Vanc (Qualificate)
Juliana Fedak / 
Anastasija Rodionova
Andreea Vanc
Audra Cohen
Jasmin Wöhr
Nastas'sja Jakimava
Juliana Fedak